Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FOXC1Q12948 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FOXC1Q12948 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms