Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXF1Q12946 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXF1Q12946 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms