Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SREBF2Q12772 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SREBF2Q12772 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
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