Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 snR5snR5 204 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 OPI6YDL096C 327 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 PAU10YDR542W 363 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 PAU11YGL261C 363 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 ASG7YJL170C 630 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 LSM8YJR022W 330 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SRP21YKL122C 504 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SRL3YKR091W 741 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 PAU4YLR461W 363 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YOR277CYOR277C 309 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 LOA1YPR139C 903 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 AIM4YBR194W 372 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 MDN1YLR106C 14733 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YDL180WYDL180W 1644 nt3.3□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 VMA8YEL051W 771 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 EMC4YGL231C 573 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 RPL19BYBL027W 570 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SHH3YMR118C 591 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 RPS16AYMR143W 432 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 CSI2YOL007C 1026 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YPL107WYPL107W 747 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 NIP7YPL211W 546 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YPR170CYPR170C 336 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 EXO5YBR163W 1758 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 SPP382YLR424W 2127 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 IOC3YFR013W 2364 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 KAR9YPL269W 1935 nt3.29□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 RPN1YHR027C 2982 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 snR9snR9 187 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 COG2YGR120C 789 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 ENV10YLR065C 546 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 TFC1YBR123C 1950 nt3.28□□□□□ -1.88
TRM8Q12009 YKL222CYKL222C 2118 nt3.28□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 TOM70YNL121C 1854 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 FAR7YFR008W 666 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 LRP1YHR081W 555 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 GMC2YLR445W 567 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 SEC14YMR079W 915 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YBR062CYBR062C 543 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 NTC20YBR188C 423 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YBR300CYBR300C 498 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 RIX1YHR197W 2292 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YCL019WYCL019W 5313 nt3.27□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 TAO3YIL129C 7131 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 ARO1YDR127W 4767 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 SPO71YDR104C 3738 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YDL163WYDL163W 303 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YDR509WYDR509W 348 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 TDA2YER071C 381 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YJR087WYJR087W 351 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 MRPL16YBL038W 699 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YMR141CYMR141C 309 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 SSN8YNL025C 972 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YNL235CYNL235C 432 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 SWD3YBR175W 948 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 SKO1YNL167C 1944 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 PCK1YKR097W 1650 nt3.26□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 SCY1YGL083W 2415 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 RPN3YER021W 1572 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 STE6YKL209C 3873 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 VHR1YIL056W 1923 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 SMC3YJL074C 3693 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 EXO84YBR102C 2262 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 STN1YDR082W 1485 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 NSA2YER126C 786 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YMR254CYMR254C 309 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 RHO5YNL180C 996 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 SFM1YOR021C 642 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YPL068CYPL068C 882 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 EMP70YLR083C 2004 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 KAP104YBR017C 2757 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 ARK1YNL020C 1917 nt3.25□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 NMA111YNL123W 2994 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 ICR1ICR1 3199 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 YGL159WYGL159W 1113 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 VMA6YLR447C 1038 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 UNG1YML021C 1080 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 ATP18YML081C-A 180 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 IRC21YMR073C 606 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 NGL1YOL042W 1092 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 SLP1YOR154W 1764 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 VPS30YPL120W 1674 nt3.24□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 NUP60YAR002W 1620 nt3.23□□□□□ -1.89
TRM8Q12009 TFB1YDR311W 1929 nt3.23□□□□□ -1.89
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