Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFFO1Q0D2I5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFFO1Q0D2I5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms