Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CD47Q08722 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CD47Q08722 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD47Q08722 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD47Q08722 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD47Q08722 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD47Q08722 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CD47Q08722 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CD47Q08722 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CD47Q08722 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD47Q08722 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD47Q08722 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD47Q08722 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD47Q08722 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CD47Q08722 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms