Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNK2Q07912 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNK2Q07912 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms