Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	RPF1	YHR088W	888 nt		4.2	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	RPL15A	YLR029C	615 nt		4.2	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YNR034W-A	YNR034W-A	297 nt		4.2	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	MSR1	YHR091C	1932 nt		4.2	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	KAR9	YPL269W	1935 nt		4.2	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	EAP1	YKL204W	1899 nt		4.2	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	FMP25	YLR077W	1752 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	SHE4	YOR035C	2370 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	SCY1	YGL083W	2415 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	snR59	snR59	78 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YDL032W	YDL032W	312 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YDR149C	YDR149C	708 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	VMA8	YEL051W	771 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	RPL13B	YMR142C	600 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	CSI2	YOL007C	1026 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	PEX11	YOL147C	711 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	ATX2	YOR079C	942 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YPL142C	YPL142C	318 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YBR141W-A	YBR141W-A	96 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	EXO5	YBR163W	1758 nt		4.19	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	SPT6	YGR116W	4356 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	MDN1	YLR106C	14733 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	CDC26	YFR036W	375 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YIL046W-A	YIL046W-A	165 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	FYV7	YLR068W	456 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	PDR17	YNL264C	1053 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YNL324W	YNL324W	396 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	SFM1	YOR021C	642 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	MRPL40	YPL173W	894 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YBR062C	YBR062C	543 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YDR338C	YDR338C	2088 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	CIN1	YOR349W	3045 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YPR022C	YPR022C	3402 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	NCS2	YNL119W	1482 nt		4.18	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	SKO1	YNL167C	1944 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	PHR1	YOR386W	1698 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	CWH41	YGL027C	2502 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	EMI1	YDR512C	564 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	VEL1	YGL258W	621 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YHL026C	YHL026C	948 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	GEP4	YHR100C	558 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	RPL16A	YIL133C	600 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YLR252W	YLR252W	306 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YBR051W	YBR051W	351 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	HFM1	YGL251C	3564 nt		4.17	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	PWP2	YCR057C	2772 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	RSR1	YGR152C	819 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	VPS51	YKR020W	495 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YLR076C	YLR076C	423 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YLR224W	YLR224W	1110 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	RIM9	YMR063W	720 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	YPL088W	YPL088W	1029 nt		4.16	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	SEC15	YGL233W	2733 nt		4.15	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	CHS3	YBR023C	3498 nt		4.15	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	PHO81	YGR233C	3537 nt		4.15	□□□□□ -1.74
NSE3	Q05541	Q0142	Q0142	177 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YGR042W	YGR042W	816 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	LSM1	YJL124C	519 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	SOP4	YJL192C	705 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	RPC37	YKR025W	849 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	MRPL44	YMR225C	297 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	ARO1	YDR127W	4767 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	URA2	YJL130C	6645 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	VPS30	YPL120W	1674 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	ZDS2	YML109W	2829 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	RAD1	YPL022W	3303 nt		4.15	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	ECM22	YLR228C	2445 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	RGL1	YPL066W	1440 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	ALA1	YOR335C	2877 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	GRS2	YPR081C	1857 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	RSM24	YDR175C	960 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YDR537C	YDR537C	606 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	RTT105	YER104W	627 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	PRM8	YGL053W	714 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	PDP3	YLR455W	915 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YGL140C	YGL140C	3660 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	DAN4	YJR151C	3486 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	TAF1	YGR274C	3201 nt		4.14	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	MUS81	YDR386W	1899 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	DSF2	YBR007C	2211 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	ZDS1	YMR273C	2748 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	SSM4	YIL030C	3960 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YPR003C	YPR003C	2265 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	SNA4	YDL123W	423 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	BCD1	YHR040W	1101 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	ARC18	YLR370C	537 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YOR277C	YOR277C	309 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YPR108W-A	YPR108W-A	213 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	HOP1	YIL072W	1818 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YRR1	YOR162C	2433 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	NUP60	YAR002W	1620 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	RAD5	YLR032W	3510 nt		4.13	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	ETP1	YHL010C	1758 nt		4.12	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	HNT1	YDL125C	477 nt		4.12	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	RPL9A	YGL147C	576 nt		4.12	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YHR130C	YHR130C	336 nt		4.12	□□□□□ -1.75

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