Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 UBP15YMR304W 3693 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 YKL075CYKL075C 1353 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 AVT5YBL089W 1380 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 PET100YDR079W 336 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 MRPL9YGR220C 810 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 MMF1YIL051C 438 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 VPS51YKR020W 495 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 ERV41YML067C 1059 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 SUB1YMR039C 879 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 YOL114CYOL114C 609 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 IRC14YOR135C 342 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 RRG7YOR305W 729 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 BTS1YPL069C 1008 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 YBR259WYBR259W 2067 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 KRE33YNL132W 3171 nt2.16□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 SEC16YPL085W 6588 nt2.15□□□□□ -2.06
TRM12Q04235 FAR11YNL127W 2862 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 AI3Q0060 1248 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 HMO1YDR174W 741 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YEL057CYEL057C 702 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 RPS24AYER074W 408 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 PEA2YER149C 1263 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 LTP1YPR073C 486 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 CBP6YBR120C 489 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 CTP1YBR291C 900 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 VMA9YCL005W-A 222 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 INP53YOR109W 3324 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 MSH4YFL003C 2637 nt2.15□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 TPS2YDR074W 2691 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 BOI1YBL085W 2943 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YPK1YKL126W 2043 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 GCN4YEL009C 846 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YGL159WYGL159W 1113 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 TDA10YGR205W 873 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 OTU2YHL013C 924 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 RPA12YJR063W 378 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YNL171CYNL171C 369 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YOL134CYOL134C 390 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 HSP10YOR020C 321 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 SPB1YCL054W 2526 nt2.14□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 snR68snR68 136 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 SNU23YDL098C 585 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 TCA17YEL048C 459 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 COBQ0105 1158 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 ERG28YER044C 447 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 UBC12YLR306W 567 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 RPS29AYLR388W 171 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 ECM13YBL043W 774 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YNL234WYNL234W 1281 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 UTP22YGR090W 3714 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 ALK2YBL009W 2031 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 FIR1YER032W 2631 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 KHA1YJL094C 2622 nt2.13□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 KAR5YMR065W 1515 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 POL4YCR014C 1749 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YJR071WYJR071W 369 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 ATP7YKL016C 525 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YLL044WYLL044W 447 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 RIF2YLR453C 1188 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YMR099CYMR099C 894 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 GRX7YBR014C 612 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 SRL1YOR247W 633 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 RRP7YCL031C 894 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 PUT3YKL015W 2940 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 URK1YNR012W 1506 nt2.12□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 TRS130YMR218C 3309 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 UPF3YGR072W 1164 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 PFS1YHR185C 714 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 OMA1YKR087C 1038 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 CDC123YLR215C 1083 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 TSR4YOL022C 1227 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 RPL25YOL127W 429 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 SGT1YOR057W 1188 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 HAT1YPL001W 1125 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 PEX5YDR244W 1839 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 EDS1YBR033W 2760 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 RRI1YDL216C 1323 nt2.11□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 SLY41YOR307C 1362 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 UFD4YKL010C 4452 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 GCV2YMR189W 3105 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 TAE2YPL009C 3117 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YDR131CYDR131C 1671 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 STN1YDR082W 1485 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YJL169WYJL169W 369 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 DGR1YNL130C-A 147 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 ATG19YOL082W 1248 nt2.1□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 MCD1YDL003W 1701 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 SWA2YDR320C 2007 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 MRP10YDL045W-A 288 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YDR336WYDR336W 945 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YGR168CYGR168C 1131 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 NNF1YJR112W 606 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 MET14YKL001C 609 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 MCR1YKL150W 909 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 YLL047WYLL047W 384 nt2.09□□□□□ -2.07
TRM12Q04235 ICY1YMR195W 384 nt2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 171 ms