Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	PDC2	YDR081C	2778 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	RMT2	YDR465C	1239 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	VAB2	YEL005C	849 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	CWC23	YGL128C	852 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	SPO11	YHL022C	1197 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	MRPL38	YKL170W	417 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	SRL3	YKR091W	741 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	YLR297W	YLR297W	390 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	HUA2	YOR284W	732 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	ARP5	YNL059C	2268 nt		3.23	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	RRM3	YHR031C	2172 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	DSE2	YHR143W	978 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	YKR033C	YKR033C	426 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	UNG1	YML021C	1080 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	YPL142C	YPL142C	318 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	YKL100C	YKL100C	1764 nt		3.22	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	CSR2	YPR030W	3366 nt		3.21	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	GYP7	YDL234C	2241 nt		3.21	□□□□□ -1.89
SYF1	Q04048	YDL158C	YDL158C	309 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	HMO1	YDR174W	741 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YHL002C-A	YHL002C-A	489 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	QCR10	YHR001W-A	234 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YHR052W-A	YHR052W-A	195 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YHR054W-A	YHR054W-A	195 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	ATG10	YLL042C	504 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YLR050C	YLR050C	486 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	URA5	YML106W	681 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	END3	YNL084C	1050 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	IKI3	YLR384C	4050 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	STN1	YDR082W	1485 nt		3.21	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	CBP2	YHL038C	1893 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	VHR2	YER064C	1518 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YCK2	YNL154C	1641 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	MSH4	YFL003C	2637 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	GET1	YGL020C	708 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	IKI1	YHR187W	930 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	JIP3	YLR331C	378 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	VMA6	YLR447C	1038 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YNL203C	YNL203C	612 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	GRX5	YPL059W	453 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	AIM4	YBR194W	372 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	HOP1	YIL072W	1818 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	GCD6	YDR211W	2139 nt		3.2	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	AVT2	YEL064C	1443 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	FKS3	YMR306W	5358 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	SRD1	YCR018C	666 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YFR054C	YFR054C	579 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YGL159W	YGL159W	1113 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	EMC6	YLL014W	327 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	SPR2	YOR214C	711 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	RPC40	YPR110C	1008 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	AYT1	YLL063C	1425 nt		3.19	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	DSE4	YNR067C	3354 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	SLP1	YOR154W	1764 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	SRC1	YML034W	2505 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	RSM24	YDR175C	960 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	DYN2	YDR424C	279 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	HLR1	YDR528W	1272 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YHR032W-A	YHR032W-A	180 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	PEX18	YHR160C	852 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YIL046W-A	YIL046W-A	165 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	ADI1	YMR009W	540 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YNL043C	YNL043C	321 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YNL089C	YNL089C	477 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YCL019W	YCL019W	5313 nt		3.18	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YJL132W	YJL132W	2253 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	PTP3	YER075C	2787 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YDR381C-A	YDR381C-A	345 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YKL069W	YKL069W	543 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	DAD2	YKR083C	402 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	LIP2	YLR239C	987 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	OSW7	YFR039C	1533 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	TFC4	YGR047C	3078 nt		3.17	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	BUD4	YJR092W	4344 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	PHD1	YKL043W	1101 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	ARC18	YLR370C	537 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	GIM5	YML094W	492 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	DYN3	YMR299C	939 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	YOR277C	YOR277C	309 nt		3.16	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	FUS2	YMR232W	2034 nt		3.15	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	SGS1	YMR190C	4344 nt		3.15	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	ITC1	YGL133W	3795 nt		3.15	□□□□□ -1.9
SYF1	Q04048	BTN2	YGR142W	1233 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	ASG7	YJL170C	630 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	PEX27	YOR193W	1131 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	MGE1	YOR232W	687 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YOR385W	YOR385W	873 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	YPL107W	YPL107W	747 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	CIN2	YPL241C	807 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	snR24	snR24	89 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	NUR1	YDL089W	1455 nt		3.15	□□□□□ -1.91
SYF1	Q04048	CCT7	YJL111W	1653 nt		3.14	□□□□□ -1.91

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