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Protein–RNA interactions for Protein: Q03048
COF1, Cofilin, yeast
Known RBP
Predictions only
Length
143 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
COF1
Q03048
FIG1
YBR040W
897 nt
1.62
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
PRM4
YPL156C
855 nt
1.62
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
SSP1
YHR184W
1716 nt
1.62
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
HAA1
YPR008W
2085 nt
1.62
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
MSB1
YOR188W
3414 nt
1.62
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
MUB1
YMR100W
1863 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
ART10
YLR392C
1557 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
CSM2
YIL132C
642 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
YAL031W-A
YAL031W-A
309 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
SRN2
YLR119W
642 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
ATG3
YNR007C
933 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
IRC20
YLR247C
4671 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
REV1
YOR346W
2958 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
HOP1
YIL072W
1818 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
PDR11
YIL013C
4236 nt
1.61
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
SCH9
YHR205W
2475 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
RTT101
YJL047C
2529 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
MPC3
YGR243W
441 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
PCL7
YIL050W
858 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
VTI1
YMR197C
654 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
MDJ2
YNL328C
441 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
BUD2
YKL092C
3315 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
YNL144C
YNL144C
2223 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
YHR078W
YHR078W
1659 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
MGM1
YOR211C
2646 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
GIS1
YDR096W
2685 nt
1.6
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
RAV2
YDR202C
1056 nt
1.59
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
tF(GAA)D
tF(GAA)D
73 nt
1.59
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
tF(GAA)N
tF(GAA)N
73 nt
1.59
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
EMI1
YDR512C
564 nt
1.59
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
URA5
YML106W
681 nt
1.59
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
YNL035C
YNL035C
1170 nt
1.59
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
YAP7
YOL028C
738 nt
1.59
□□□□□ -2.15
COF1
Q03048
STE11
YLR362W
2154 nt
1.59
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
GDI1
YER136W
1356 nt
1.59
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
RUD3
YOR216C
1455 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
FUS1
YCL027W
1539 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
TIF35
YDR429C
825 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
IRC4
YDR540C
540 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YMR31
YFR049W
372 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YKL033W-A
YKL033W-A
711 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
BET5
YML077W
480 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
MFA2
YNL145W
117 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
NGL1
YOL042W
1092 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
PSK2
YOL045W
3306 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
PDR1
YGL013C
3207 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
SIR4
YDR227W
4077 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
NUF2
YOL069W
1356 nt
1.58
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
VPS15
YBR097W
4365 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
PDS5
YMR076C
3834 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
FKS3
YMR306W
5358 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
SYO1
YDL063C
1863 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YGR226C
YGR226C
210 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YHR210C
YHR210C
1026 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YAL059C-A
YAL059C-A
423 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
RAD10
YML095C
633 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
RPB8
YOR224C
441 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
DSE3
YOR264W
1293 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
CFT2
YLR115W
2580 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
PEP1
YBL017C
4740 nt
1.57
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
SIP3
YNL257C
3690 nt
1.56
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
KAR5
YMR065W
1515 nt
1.56
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
HMF1
YER057C
390 nt
1.56
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
tT(UGU)H
tT(UGU)H
72 nt
1.56
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
HUA2
YOR284W
732 nt
1.56
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
COA2
YPL189C-A
207 nt
1.56
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YPR014C
YPR014C
330 nt
1.56
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
snR191
snR191
274 nt
1.56
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
LRE1
YCL051W
1752 nt
1.55
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YCR064C
YCR064C
411 nt
1.55
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YLR347W-A
YLR347W-A
141 nt
1.55
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YBL055C
YBL055C
1257 nt
1.55
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
UBP2
YOR124C
3819 nt
1.55
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YLR446W
YLR446W
1302 nt
1.55
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YJL132W
YJL132W
2253 nt
1.55
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
VPH1
YOR270C
2523 nt
1.55
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YLR035C-A
YLR035C-A
3468 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
DIS3
YOL021C
3006 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YDL118W
YDL118W
381 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
CPR5
YDR304C
678 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
DIG2
YDR480W
972 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
SUP56
tL(CAA)A
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
SUP53
tL(CAA)C
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
tL(CAA)D
tL(CAA)D
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
tL(CAA)G1
tL(CAA)G1
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
SUP54
tL(CAA)G2
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
tL(CAA)G3
tL(CAA)G3
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
tL(CAA)K
tL(CAA)K
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
tL(CAA)L
tL(CAA)L
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
tL(CAA)M
tL(CAA)M
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
tL(CAA)N
tL(CAA)N
82 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
RPS25A
YGR027C
327 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YHL044W
YHL044W
708 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
SKG1
YKR100C
1068 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
YLR379W
YLR379W
375 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
GCY1
YOR120W
939 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
MCT1
YOR221C
1083 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
RFC5
YBR087W
1065 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
MED8
YBR193C
672 nt
1.54
□□□□□ -2.16
COF1
Q03048
SCD5
YOR329C
2619 nt
1.54
□□□□□ -2.16
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