Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RNR2YJL026W 1200 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 DLS1YJL065C 504 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 ECI1YLR284C 843 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 RPL19BYBL027W 570 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YBR063CYBR063C 1215 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 SEC66YBR171W 621 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 YCL002CYCL002C 792 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 ASI3YNL008C 2031 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 VPS30YPL120W 1674 nt2.84□□□□□ -1.95
SKO1Q02100 STI1YOR027W 1770 nt2.84□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 TGL3YMR313C 1929 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 BIT61YJL058C 1632 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 KEI1YDR367W 666 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 DOG2YHR043C 741 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 COX23YHR116W 456 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 BAT1YHR208W 1182 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 RCN1YKL159C 636 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YMR181CYMR181C 465 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YNL013CYNL013C 378 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YBL065WYBL065W 345 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 NGL1YOL042W 1092 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 AFT2YPL202C 1251 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 FAR1YJL157C 2493 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 STE23YLR389C 3084 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 STE6YKL209C 3873 nt2.83□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 BOI1YBL085W 2943 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 TSC11YER093C 4293 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 NTF2YER009W 378 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 MIC19YFR011C 513 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 PEF1YGR058W 1008 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YJL147CYJL147C 1149 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 LIP2YLR239C 987 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YAR069CYAR069C 294 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 UNG1YML021C 1080 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 INP1YMR204C 1263 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YPL107WYPL107W 747 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 DSE4YNR067C 3354 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 ADY4YLR227C 1482 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 APM3YBR288C 1452 nt2.82□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YMR317WYMR317W 3423 nt2.81□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YCR099CYCR099C 468 nt2.81□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 TCD1YHR003C 1290 nt2.81□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt2.81□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YET1YKL065C 621 nt2.81□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 MAL33YBR297W 1407 nt2.81□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 TFB1YDR311W 1929 nt2.81□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 RRM3YHR031C 2172 nt2.81□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YJL132WYJL132W 2253 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YPR1YDR368W 939 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 VMA8YEL051W 771 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 RSR1YGR152C 819 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YIP1YGR172C 747 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 PPX1YHR201C 1194 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YIL054WYIL054W 318 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 ASG7YJL170C 630 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 SFT1YKL006C-A 294 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YRO2YBR054W 1035 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 PUF6YDR496C 1971 nt2.8□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 TAF2YCR042C 4224 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 SLP1YOR154W 1764 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 SLF1YDR515W 1344 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 PCI8YIL071C 1335 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 MIX14YDR031W 366 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 BMH2YDR099W 822 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 RSM18YER050C 417 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YIL012WYIL012W 342 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 SDS22YKL193C 1017 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 GOT1YMR292W 417 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YOL107WYOL107W 1029 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YBR051WYBR051W 351 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 PSK1YAL017W 4071 nt2.79□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YDR338CYDR338C 2088 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 RGR1YLR071C 3249 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 ESC2YDR363W 1371 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YKL091CYKL091C 933 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 AIM36YMR157C 768 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 RPL20AYMR242C 519 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YBR062CYBR062C 543 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 TMA64YDR117C 1698 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 RPN1YHR027C 2982 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 YCT1YLL055W 1596 nt2.78□□□□□ -1.96
SKO1Q02100 FRE2YKL220C 2136 nt2.77□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SHS1YDL225W 1656 nt2.77□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 RPL17BYJL177W 555 nt2.77□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 VPS63YLR261C 327 nt2.77□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 SRL4YPL033C 846 nt2.77□□□□□ -1.97
SKO1Q02100 AI2Q0055 2565 nt2.77□□□□□ -1.97
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