Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDR2Q01850 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms