Protein–RNA interactions for Protein: Q01766

HAL1, Halotolerance protein HAL1, yeastyeast

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL1Q01766 YHR213WYHR213W 597 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YJL007CYJL007C 315 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YAR062WYAR062W 597 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 UNG1YML021C 1080 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 IMP4YNL075W 873 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 TOA1YOR194C 861 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 AFT2YPL202C 1251 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 BEM4YPL161C 1902 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 RGL1YPL066W 1440 nt2.5□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 ROM1YGR070W 3468 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 IRC3YDR332W 2070 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 SLK19YOR195W 2466 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 BRE5YNR051C 1548 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 FRQ1YDR373W 573 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 RPS8BYER102W 603 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 PRM8YGL053W 714 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YGR042WYGR042W 816 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YHR212CYHR212C 336 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 AGE2YIL044C 897 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 ACF4YJR083C 930 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YAR060CYAR060C 336 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 RPS8AYBL072C 603 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 ATX1YNL259C 222 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 SEC66YBR171W 621 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 SSM4YIL030C 3960 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 RRM3YHR031C 2172 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 ITT1YML068W 1395 nt2.49□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 MAK21YDR060W 3078 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 GAL80YML051W 1308 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 SYO1YDL063C 1863 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 NCS2YNL119W 1482 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YDR199WYDR199W 366 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 FMP32YFL046W 624 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YLR257WYLR257W 966 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YNL150WYNL150W 408 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 RFC3YNL290W 1023 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 TPK2YPL203W 1143 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 MBA1YBR185C 837 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 SEC15YGL233W 2733 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 RAD2YGR258C 3096 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 SLA1YBL007C 3735 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 TRS120YDR407C 3870 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 SKO1YNL167C 1944 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 LCB4YOR171C 1875 nt2.48□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 SNU56YDR240C 1479 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 ARF1YDL192W 546 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 PSF1YDR013W 627 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YDR090CYDR090C 933 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 GRX2YDR513W 432 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 RPL11BYGR085C 525 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 MVB12YGR206W 306 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 CSE4YKL049C 690 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 TDA8YAL064C-A 381 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 VPS63YLR261C 327 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 BER1YLR412W 825 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 RHO5YNL180C 996 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 MPD2YOL088C 834 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 ATX2YOR079C 942 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 LTP1YPR073C 486 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 RPL11AYPR102C 525 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 VAC14YLR386W 2643 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 NSA1YGL111W 1392 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YNR063WYNR063W 1824 nt2.47□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YEL025CYEL025C 3567 nt2.46□□□□□ -2.01
HAL1Q01766 YDR089WYDR089W 2610 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 GIS4YML006C 2325 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 RPN3YER021W 1572 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 CCM1YGR150C 2595 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 MIX14YDR031W 366 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 VMA8YEL051W 771 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 SPT2YER161C 1002 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 PUG1YER185W 912 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 SMX2YFL017W-A 234 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 YFR054CYFR054C 579 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 RPS23AYGR118W 438 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 BCD1YHR040W 1101 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 RPL22AYLR061W 366 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 SYM1YLR251W 594 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 YLR252WYLR252W 306 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 YNL089CYNL089C 477 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 GIS2YNL255C 462 nt2.46□□□□□ -2.02
HAL1Q01766 PHO80YOL001W 882 nt2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.9 ms