Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MC1RQ01726 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MC1RQ01726 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms