Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NFKB2Q00653 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFKB2Q00653 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFKB2Q00653 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFKB2Q00653 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFKB2Q00653 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFKB2Q00653 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFKB2Q00653 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFKB2Q00653 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NFKB2Q00653 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms