Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NDPQ00604 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NDPQ00604 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDPQ00604 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDPQ00604 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDPQ00604 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDPQ00604 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDPQ00604 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NDPQ00604 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NDPQ00604 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NDPQ00604 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms