Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP1Q00587 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms