Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF2BQ00403 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms