Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SKOR1P84550 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SKOR1P84550 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms