Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUCB2P80303 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUCB2P80303 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms