Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX3P78415 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRX3P78415 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRX3P78415 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX3P78415 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX3P78415 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX3P78415 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRX3P78415 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRX3P78415 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms