Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPC5P78333 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPC5P78333 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPC5P78333 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPC5P78333 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPC5P78333 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPC5P78333 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPC5P78333 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GPC5P78333 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPC5P78333 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms