Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HBBP68871 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HBBP68871 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HBBP68871 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HBBP68871 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HBBP68871 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HBBP68871 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms