Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
ATP12AP54707 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP12AP54707 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms