Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-5P52952 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-5P52952 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms