Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DAP3P51398 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DAP3P51398 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DAP3P51398 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DAP3P51398 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DAP3P51398 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DAP3P51398 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DAP3P51398 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms