Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BCAMP50895 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCAMP50895 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BCAMP50895 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BCAMP50895 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAMP50895 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAMP50895 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAMP50895 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAMP50895 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAMP50895 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAMP50895 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BCAMP50895 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BCAMP50895 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BCAMP50895 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms