Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRIM1P49642 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRIM1P49642 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms