Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NOP2P46087 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOP2P46087 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP2P46087 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP2P46087 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP2P46087 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP2P46087 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOP2P46087 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOP2P46087 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOP2P46087 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOP2P46087 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOP2P46087 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms