Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
APOBEC1P41238 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
APOBEC1P41238 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms