Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHRNA7P36544 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms