Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NTF4P34130 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NTF4P34130 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NTF4P34130 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NTF4P34130 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NTF4P34130 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NTF4P34130 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF4P34130 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NTF4P34130 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms