Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASP1P29466 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASP1P29466 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASP1P29466 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASP1P29466 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms