Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD10P28358 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD10P28358 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD10P28358 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms