Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2AP24928 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2AP24928 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms