Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDELR1P24390 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KDELR1P24390 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms