Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TNFSF4P23510 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms