Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRAP18433 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRAP18433 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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