Protein–RNA interactions for Protein: P18077

RPL35A, 60S ribosomal protein L35a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35AP18077 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPL35AP18077 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL35AP18077 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms