Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF7P17544 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF7P17544 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATF7P17544 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATF7P17544 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF7P17544 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATF7P17544 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATF7P17544 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms