Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CD46P15529 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CD46P15529 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CD46P15529 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CD46P15529 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CD46P15529 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CD46P15529 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms