Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SKIP12755 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SKIP12755 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SKIP12755 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SKIP12755 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIP12755 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIP12755 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIP12755 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIP12755 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SKIP12755 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SKIP12755 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SKIP12755 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms