Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC175P0C221 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC175P0C221 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms