Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLTAP09496 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLTAP09496 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLTAP09496 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLTAP09496 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLTAP09496 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLTAP09496 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms