Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHBP07195 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHBP07195 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHBP07195 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHBP07195 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHBP07195 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDHBP07195 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDHBP07195 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDHBP07195 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LDHBP07195 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDHBP07195 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDHBP07195 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHBP07195 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHBP07195 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHBP07195 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHBP07195 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDHBP07195 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LDHBP07195 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LDHBP07195 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms