Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GGPS1O95749 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGPS1O95749 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms