Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTDNEP1O95476 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTDNEP1O95476 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms