Protein–RNA interactions for Protein: O75477

ERLIN1, Erlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERLIN1O75477 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERLIN1O75477 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms