Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VAMP4O75379 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VAMP4O75379 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms